經濟部生物技術與醫藥工業發展推動小組的主要任務有：
- 協調相關部會選擇生技、西藥、中草藥及醫療保健產業之重點項目與發展計畫。
- 協調相關部會建立完善生物技術與醫藥工業研發體系。
- 協調相關部會改善國內生物技術與醫藥工業的投資發展環境。
- 協調相關部會、研究機構、學術單位及公民營企業等規劃推動產業發展策略與計畫，並促成研究成果移轉產業界。
- 協調相關部會修正或訂定有關生物技術與醫藥工業發展法規。
- 推動生物技術與醫藥工業的國際合作與投資，並協助國內外企業以台灣為研發、製造及營運中心。
- 辦理「行政院生物技術產業單一窗口」相關業務，並協助加強生物技術產業推動工作。
- 推動其他有關生物技術與醫藥工業發展的重要事項。